La haute atmosphère de Jupiter composée essentiellement à 93 % d'hydrogène, 7 % d'hélium en nombre d'atomes. En quantité de molécules compter 86 % d'hydrogène, 13 % d'hélium. Son important champ magnétique s'étend sur 650 millions de kilomètres.
La chaleur interne est évaluée à 20 000 K soit l'équivalent 19726,85 degré Celsius. Ces températures élevées sont les conséquences directes d'un phénomène de compression gravitationnelle obtenu par sa lenteur de rotation, un mécanisme appelé Kelvin-Helmholtz.
En masse, l'atmosphère majoritairement composée d'hydrogène 75 %, d'hélium 24 %, le pourcentage restant étant apporté par divers autres éléments, notamment des composés chimiques, des traces de méthane, des vapeurs d'eaux, également d'ammoniac puis de très petites quantités de carbone. On retrouve aussi d'autre composant, l'éthane, sulfure d'hydrogène, néon, oxygène, hydrure de phosphore, soufre. La composition chimique de Jupiter étant vraiment singulière.
Suite aux mesures par infrarouges et ultraviolettes, on distingue maintenant la présence de benzène et différents hydrocarbures. L'intérieur de Jupiter contient des matériaux à densités supérieur, dont la distribution par masse se répartie de la manière suivante, 71 % d'hydrogène, 24 % d'hélium, 5 % d'éléments divers.